Pada Mikrokontroller Atmega terdapat 40 pin dimana fungsi kaki-kaki tersebut yaitu:
Pin 1 - 8 PORTB, merupakan Port I/O 8 bit dua arah dengan resistor pull-up internal. Selain sebagai Port I/O 8 bit Port B juga dapat difungsikan secara individu sebagai berikut :
PB7 : SCK (SPI Serial Clock)
PB6 : MISO (SPI Bus Master Input /Slave Output)
PB5 : MOSI (SPI Bus Master Output /Slave Input)
PB4 : SS (SPI Slave Select Input)
PB3 : AIN1 (Analog Comparator Negatif Input)
OC0 (Output Compare Timer/Counter)
PB2 : AIN0 (Analog Comparator Positif Input)
INT2 (External Interrupt 2 Input)
PB1 : T1 (Timer/Counter 1 External Counter Input)
PB0 : T0 (Timer/Counter 0 external Counter Input)
PIN 9 RESET, merupakan pin reset yang akan bekerja bila diberi pulsa rendah (aktif low ) selama minimal 1,5 us.
PIN 10 VCC, Catu Daya Digital.
PIN 11 GND, Ground untuk catu daya digital.
PIN 12 XTAL2, Merupakan output dari penguat osilator pembalik.
PIN 13 XTAL1, Merupakan input ke penguat osilator pembalik dan input ke
internal clock.
PIN 14 - 21 PORT D, merupakan Port I/O 8-bit dua arah dengan resistor pull-up internal. Selain sebagai Port i/O 8 bit port D juga dapat difungsikan secara individu sebagai berikut :
PD7 : OC2 (Output Compare Timer/ Counter 2)
PD6 : ICP1 (Timer/ Counter 1 Input Capture)
PD5 : OC1A (Output Compare A Timer / Counter 1)
PD4 : OC1B (Output Compare B Timer / Counter 1)
PD3 : INT1 (External Interrupt 1 Input )
PD2 : INT0 (External interrupt 0 Input)
PD1 : TXD (USART transmit)
PD0 : RXD (USART receive)
PIN 22 - 29 PORT C, merupakan Port I/O 8 bit dua arah dengan resistor pull-up internal. Selain sebagai Port I/O 8 bit 4 bit Port C juga dapat difungsikan secara individu sebagai berikut :
PC7 : TOSC2 ( Timer Oscilator 2 )
PC6 : TOSC1 ( Timer Oscilator 1 )
PC1 : SDA (Serial Data Input /Output, I2C)
PC0 : SCL (Serial Clock, I2C)
PIN 30 AVCC, merupakan catu daya yang digunakan untuk masukan analog ADC yang terhubung ke Port A.
PIN 31 GND, Ground untuk catu daya analog.
PIN 32 AREF, merupakan tegangan referensi analog untuk ADC.
PIN 33 - 40 PORT A, merupakan Port I/O 8 bit dua arah dengan resistor pull-up internal. Selain sebagai Port I/O 8 bit Port A juga dapat berfungsi sebagai masukan 8 channel ADC.